跑步三天体重增加的原因可能出在以下几个方面：

一是当初体重计算有误，或者体重波动在正常范围内，但是由于跑步引起了脂肪细胞内水分的浸润，导致体重的短暂增加。

此外，如果跑步前补充了大量饮食，可能使得体内水分和盐分过多，进而产生增重的情况。

最后，跑步初期也可能会带来肌肉重量的增加，而肌肉重量是高于脂肪重量的，因此也会使得体重增加。总之，这种情况并不需要过分担心，只要坚持每天定时定量的跑步，相信体重会逐渐恢复正常。