如果农村宅基地房屋被查封后连续三年都未解封，可能会被法院依法进行拍卖。拍卖所得款项将优先用于清偿拍卖费用和债务，剩余的部分用于归还宅基地所有人或者其他利害关系人的债权。但是，是否拍卖还要根据具体情况而定，需要咨询相关法律专业人士进行分析判断。