上海外来人员综合保险余额查询方法如下：

1. 拨打12333社保客服热线，按照人工提示进行查询。

2. 持卡到办理综合保险的部门去查询。

3. 拿卡到所属社保局网上查询。

请注意，以上方法仅供参考，具体操作可能因实际情况而有所不同。