自考毕业档案的归档方法如下：
如果考生已经毕业，且已经将档案托管到当地的人才中心，那么该中心会负责将考生的档案进行归档。
如果考生将档案带回原籍，当地会接受考生的档案，但需要考生有介绍信。
如果考生毕业后将档案托管到单位，一般接受档案管理的都是一些大型的国企或者机关单位，小的企业一般都没有档案管理权限。
如果考生在毕业后将档案交到自己的手中，需要将档案交到当地自考办进行密封，并由考生本人交到自己的档案存放机构进行合并存档。自考本科或者是专科毕业档案一般由省自考办和主考院校共同签署盖章后正式生效，一般一式三份，省自考办和主考院校各留一份存档，另一份由考生本人交到自己的档案存放机构进行合并存档。