首阶段共有7个口岸开放，包括深圳湾口岸、落马洲口岸、文锦渡口岸、港珠澳大桥、机场、港澳码头、中港码头。当中，5万人经3个陆路口岸——深圳湾口岸、文锦渡口岸及落马洲支线口岸（福田口岸）过关，1万人经港珠澳大桥、机场、码头过关。