菊花砧木主要有两种：小菊砧木和大菊砧木。

小菊砧木主要有南京小菊、红毛小菊和杭小菊。

南京小菊叶片小，分枝力强，萌芽力强，嫁接亲和性较好，抗寒能力强，但耐热性和耐旱性较弱。

红毛小菊，叶片小，多分枝，开花早，根系发达，抗旱性强，嫁接亲和性较好。

杭小菊，叶片小，分枝力强，抗寒性和耐旱性好，但嫁接亲和性较差，易出现嫁接不牢的情况。