作为两家不同的生物医药公司，君实生物和百济神州在公司规模、产品研发、市场营销、财务状况等方面存在一定的差距。

1. 公司规模：百济神州是中国市值最高的生物医药公司之一，拥有规模较大的研发团队和生产基地，而君实生物则相对较小。

2. 产品研发：百济神州在肿瘤、自身免疫性疾病等领域的研发取得了一定的成果，而君实生物则主要专注于消化系统疾病的治疗。

3. 市场营销：百济神州在国内外市场上的知名度和销售渠道相对较广，而君实生物则还需要进一步扩大自己的市场份额。

4. 财务状况：百济神州在去年实现了盈利，并拥有较高的现金流和资产，而君实生物则还需要在财务方面不断提升自身实力。