捣蒜神器与研磨机的主要区别在于使用方式和应用场景。捣蒜神器通常需要手动用力捣碎食材，适用于家庭厨房中少量食材的捣碎，如蒜、姜等。

而研磨机则是一种电动工具，通过高速旋转的磨盘或磨轮来磨碎食材，适用于大量食材的加工，如咖啡豆、坚果、谷物等。此外，研磨机通常具有多种磨盘和磨轮可供选择，可根据不同食材和口感需求进行调整。因此，捣蒜神器和研磨机各有优缺点，选择哪种工具取决于具体需求和场景。