内蒙古、西藏和新疆被称为自治区，主要是因为它们都是少数民族聚居地区，为了方便管理和经济发展，将这些地区单独划分为自治区。

此外，这三个省份的面积都比较大，如果按照传统的行政区划，这些地区可能会被划分为多个省份，这样不仅不利于管理和经济发展，还会导致民族关系的复杂化。

因此，将这些地区划分为自治区，可以更好地保护和传承民族文化，促进民族团结，同时也有利于管理和经济发展。