医院门诊余额可以按照以下步骤进行退款：

1. 患者需要来到医院收费处，需要告知收费员想办理退费业务，收费员会出具一个办理退费的内部窗口。

2. 患者需要提供当时缴费的收据，本人的身份证和相关的缴费本。

3. 收费员会根据提供的资料进行核实，确认无误后进行办理退费业务。

4. 退费业务办理成功后，费用会通过原支付方式退回。

需要注意的是，不同医院的具体退费流程可能略有不同，具体操作需根据医院规定进行。如有疑问，建议咨询医院工作人员。