农村别墅最节能的采暖方式是地源热泵采暖系统。该系统可以从地下提取热能用于供暖，比传统燃气、电热等采暖方式节能高效，不产生排放，对环境友好。

此外，该系统还可以与太阳能光伏系统结合，利用太阳能的热量和电能，最大化利用自然资源，实现多能互补。总之，采用地源热泵采暖系统可以节省能源，减少对环境的影响，是一种可持续发展的先进技术。