当鱼缸的过滤器在晚上时开启，小鱼们仍然可以休息。过滤器的主要功能是为鱼缸提供充足的氧气，同时帮助清除鱼缸中的废物和多余的食物，从而维持鱼缸的水质清洁。对于小鱼来说，一个干净、有足够氧气的环境是非常重要的，这有助于它们的健康。

然而，值得注意的是，过滤器的噪音可能会影响到小鱼的休息。如果过滤器的噪音过大，可能会让小鱼感到不适，从而影响到它们的休息和生长。因此，在选择过滤器时，应该选择噪音较小的型号，并且定期维护和清洁过滤器，确保其正常运行并且噪音不会过大。

另外，鱼缸的灯光也会影响小鱼的休息。如果鱼缸的灯光过强或者一直亮着，可能会让小鱼无法安心休息。因此，在晚上时，可以考虑将鱼缸的灯光调暗或者关闭，让小鱼有一个安静、舒适的环境来休息。

综上所述，当鱼缸的过滤器在晚上开启时，小鱼们仍然可以休息，但需要注意过滤器的噪音和鱼缸的灯光，确保它们不会影响到小鱼的休息。