嘉靖皇帝晚年的确沉浸在修道和玄学中，远离了朝政。他长期住在西苑修道，不与皇后嫔妃们见面，被批评没有夫妻之义；也不与儿子见面，被指没有父子之情。这种做法在儒家思想“礼”“孝”盛行的朝代，被视为有悖伦理、有悖人情。

然而，说嘉靖皇帝晚年真正忏悔并不完全准确。他的修道行为更像是一种个人信仰和追求，而非真正的悔悟。他以道家思想治国，并迷恋玄修、大兴土木。尽管他的行为受到了一些批评，但他依然坚持自己的信仰和做法。