抖音小店商家违规扣除B3分后，货款冻结的自动解除时间取决于违规的严重程度。一般来说，比较轻微的违规行为在两个月后会自动解除冻结。然而，对于严重的违规行为，货款冻结可能无法自然解除，且申诉成功率也可能较低。

如果商家希望尽快解除货款冻结，可以尝试以下方法：

在抖音小店的后台进行申诉，解释情况并提供相关证据。

发送邮件至抖音平台申请处理解除。

打电话给平台运营人员沟通，了解具体情况并寻求解决方案。

委托相关渠道或代办机构进行解除，他们可能具有更专业的知识和经验，能够更快地解决问题。

需要注意的是，申诉成功后，货款通常会在第二天解冻，商家就可以正常提现了。但具体解冻时间可能因各种因素而有所不同，建议商家耐心等待并密切关注抖音小店的相关通知。

此外，为了避免类似情况再次发生，商家应该遵守抖音小店的规则和政策，规范经营行为，确保商品质量和服务质量，以维护良好的商家形象和信誉。