1. 在自建房两边都有邻居屋的情况下，挖桩基础需要特别注意，因为涉及到邻里关系和房屋安全问题，需要谨慎处理。

2. 首先，需要征得邻居同意，并与他们协商确定挖掘的具体范围和时间，避免对邻居造成不必要的困扰和影响。

3. 其次，要根据建筑设计要求和土地地质条件，选用合适的挖掘方法和工具，确保挖掘过程中不会对邻居房屋造成损害。

4. 最后，要对挖掘过程进行严格监控和检查，确保桩基础施工的质量和稳定性，保证房屋建造的安全和可靠性。

综上所述，挖桩基础在自建房两边是邻居屋的情况下，需要注意各种细节和安全问题，做好充分的准备和协商，确保顺利完成施工。