校本课程是指学校自行设计、组织和实施的课程，通常不属于国家规定的统一课程范畴，因此在学生综合素质评价中的填写位置也与其他课程有所不同。

在学生综合素质评价中，校本课程的成绩通常填写在课外活动部分，具体填写方式如下：

1.填写方式：根据学生在校本课程中表现和学习情况评定等级。

2.评价标准：根据学校制定的校本课程评价标准进行评定，如课程设计、教学效果、实践能力等。

3.评价等级：一般设置五个等级，即优秀、良好、及格、不及格、免修。

需要注意的是，由于校本课程的开设和评价是学校自主决定的，因此在不同的学校、不同的评价体系中，可能会存在不同的评价方式和等级划分。学生在填写综合素质评价表时，应按照学校规定的评价标准和等级填写，以确保评价结果的准确性和客观性。