招标人不能指定招标机构的原因主要有以下几点：

保证公正性：如果招标人能够指定招标机构，那么可能会出现不公平的现象。指定的机构可能会倾向于招标人的利益，从而影响到其他潜在投标人的竞争机会，破坏了招标的公正性。

防止腐败：允许招标人指定招标机构可能引发腐败问题。招标人可能会选择与其有利益关系的机构，从而达到不正当的目的，损害了整个招标过程的诚信度。

提高效率：通过公开、透明的招标方式，可以吸引更多的投标人参与，从而增加竞争，提高项目的质量和效率。如果招标人能够指定招标机构，可能会限制竞争，导致项目的效果不佳。

法律法规要求：在很多国家和地区，法律规定了招标过程必须公开、公正、公平。招标人不能指定招标机构是这些法律法规的具体体现，以确保招标过程的合法性和规范性。

因此，为了保证招标的公正性、防止腐败、提高效率和遵守法律法规，招标人不能指定招标机构。招标过程应该公开、透明，确保所有潜在的投标人都能够在相同的条件下竞争，以保障整个招标过程的公平和公正。