公积金扣除是根据个人工资基数和缴存比例来计算的。一般来说，公积金缴存比例为个人缴存比例加上单位缴存比例，两者之和通常为10%-12%。

以个人工资基数为基础，按照缴存比例计算出个人和单位应缴纳的公积金金额，然后将两者相加即为公积金扣除金额。

例如，如果个人工资基数为5000元，缴存比例为10%，那么个人和单位每月应缴纳的公积金金额分别为500元，总共为1000元。