菜茶与品种茶的主要区别在于它们的定义、特点以及繁殖方式。菜茶通常指的是通过有性繁殖方式繁衍的群体种，具有品种不一致、制成的茶叶外观可能略显凌乱但口感优异、以及良好的抗逆性等特点。

而品种茶则通常指的是经过认定程序的良种，采用无性繁殖方式繁衍，以保证品种的纯正和一致性。