光等离子除菌和巴氏除菌是两种不同的除菌技术，各有其特点。光等离子除菌利用高能光子和活性氧等离子的协同作用，能够破坏细菌的细胞壁和核酸，从而达到快速、高效的除菌效果。

而巴氏除菌则通过高温短时间处理，使细菌处于致死状态，但保留了食品的营养和风味。

两者相比，光等离子除菌速度更快、效果更彻底，但可能不适用于所有食品；巴氏除菌则更温和，适用于更多种类的食品。