柴犬发出咕咕的声音可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因：

1.胃肠道问题：狗狗胃肠道消化不良时，肚子会发出咕咕的声音。这可能是由于狗狗吃了不该吃的东西或难以消化的食物，导致胃肠道需要通过更加剧烈的蠕动来帮助狗狗强行消化。此外，如果狗狗吞食了异物，可能会导致胃肠道堵塞，产生更大的声音。胃肠道疾病，如炎症性肠炎、外分泌型胰腺功能不全、胰腺炎等，也可能导致狗狗肚子发出咕咕的声音。某些胃肠道的寄生虫和细菌感染不仅影响营养吸收，也会产生大量气体，导致咕咕声。

2.饥饿感：当狗狗感到饥饿时，可能会发出咕咕的声音来向主人表示需要食物。

3.情绪表达：狗狗可能通过发出咕咕的声音来表达其情绪，如感到悲伤、孤独或想要引起主人的注意。

4.咽喉问题：狗狗的咽喉位置异常，如咽喉肿胀、增生或软腭异常，也可能导致发出咕咕的声音。

5.呼吸系统感染：狗狗呼吸系统感染，导致痰液分泌过多，也可能引起干呕和发出咕咕的声音。

请注意，这些只是一些可能的原因，并不能涵盖所有情况。如果狗狗频繁发出咕咕的声音，或者伴随其他症状如咳嗽、呼吸困难、食欲不振等，建议尽快带狗狗去兽医处进行检查，以确定具体原因并获得适当的治疗。