九眼天珠是由沉积岩打磨而成的，其天眼部分是天然形成的。虽然现在市场上也有人工制作的九眼天珠，但天然形成的九眼天珠仍然被认为是更加珍贵的。因此，九眼天珠的天眼部分是天然的。