福建莆田大排量摩托车应该走机动车道，而不是辅道。根据《道路交通安全法》的规定，机动车应当在机动车道上行驶。而摩托车也属于机动车的范畴，因此应该在机动车道上行驶。

辅道主要用于非机动车和行人通行，若摩托车行驶在辅道上，不仅与规定相违背，也容易引发交通事故。因此，摩托车应遵守交通规则，与其他机动车一起行驶在机动车道上，确保道路交通的安全有序。