广州番禺电动车车牌灭失注销一般需要三个工作日的时间。首先需要持车主身份证、行驶证、车辆购置税证明等材料到车管所办理挂失手续，办理完毕后会领取补发挂失凭证。

然后，持补发凭证、车主身份证、行驶证等材料到车管所完成车牌注销手续，提交申请后需要等待三个工作日，车辆就会被注销。注销后还需到交警大队办理注销车牌的手续。整个注销车牌的过程需要耐心等待并保证所需材料齐全。