您好，根据中国政府规定，搭乘船舶前往香港或澳门地区的旅客，需要持有有效的港澳通行证或护照，并在出发前到当地公安机关办理相关手续。

因此，如果您持有有效的港澳通行证，可以在港口的出入境办理窗口直接办理签注手续。但是建议您提前了解相关手续和注意事项，以确保顺利办理。