是的，科莫多巨蜥是保护动物。根据搜索结果1，科莫多巨蜥已经被列入保护动物的名录中，并属于易危动物。此外，根据搜索结果2，科莫多巨蜥还是国家一级保护动物。最近，根据搜索结果3，世界自然保护联盟将科莫多巨蜥的保护级别由之前的易危调整为濒危，这也就意味着科莫多龙正在灭绝的边缘。