手机卡被立案是否会被注销，取决于立案的具体原因和相关法律法规的规定。以下是一些可能的情况和解释：

涉及违法犯罪活动：如果手机卡被用于违法犯罪活动，如诈骗、传播违法信息等，相关执法机构可能会对其进行立案调查。在这种情况下，手机卡可能会被注销，以防止其继续被用于非法活动。注销的具体程序可能因地区和案件性质而异，但通常会涉及到通知用户、停止服务等步骤。

涉及欠费或违约行为：如果手机卡用户存在欠费或违约行为，如未按时缴纳话费、违反服务协议等，运营商可能会对其进行立案处理。在这种情况下，手机卡可能会被注销，以追缴欠费或违约金。注销前，运营商通常会与用户进行沟通，提醒其履行义务，但如果用户未能及时纠正违约行为，手机卡可能会被注销。

其他原因：除了上述两种情况外，还有一些其他原因可能导致手机卡被注销，如用户主动申请注销、手机号码被收回等。这些情况下，注销的具体程序和原因可能因运营商和政策而异。

总之，手机卡被立案是否会被注销取决于具体情况。如果用户发现自己的手机卡被立案了，应该及时与相关部门或运营商联系，了解具体情况并积极配合处理。同时，用户也应该遵守相关法律法规和服务协议，避免违法行为和违约行为导致手机卡被注销。