树上的疙瘩多由于树木生长过程中受到外界环境、物理或生物因素的影响而形成。例如，遭受昆虫、真菌、细菌的侵袭或感染、自然灾害、日晒雨淋等因素可能导致树木表皮或内部的生长细胞受损或死亡，从而造成疤痕或疙瘩。

此外，树木在生长过程中也可能会产生新的修护组织，这些组织的生长速度和方向可能不同于原有的组织，因而也可能形成疙瘩。总之，树上的疙瘩是树木生长过程中抵御外界因素或调整体内资源分配的结果。