杭州火车南站停车费是按照停车时间和车型收费，车型包括小型车、中型车和大型车，停车时间分为不满两小时、不满四小时、不满六小时、不满十二小时和满一天。

收费标准在车站内明示，可通过自助缴费机、收费员窗口或手机APP进行缴费。缴费后需在规定时间内离开车位，若超时则需重新计费。同时，杭州火车南站对残疾人、军人、退役士兵、烈属和公安民警等享有优惠政策。