厦门南洋职业学院实行3+2大专制度。即学生先完成三年的大专教育，然后可以选择继续攻读两年的本科课程，获得本科学位。

该制度注重培养学生的实践能力和专业技能，教学内容紧密结合就业市场需求，旨在培养高素质的应用型人才。厦门南洋职业学院的办学理念是“以人为本，创优卓越”，致力于为社会培养优秀的职业人才，为国家经济和社会的发展做出贡献。