卫矛苗根部有虫可能是感染了金龟子幼虫，它们会啃食植株的根茎，影响植株的生长。针对金龟子幼虫，可采取以下防治方法：

- 不使用没有腐熟的有机肥。

- 金龟子有趋光性，可以安装频振式杀虫灯以诱杀成虫。

- 在病害比较严重时，可以喷施克球孢白僵菌药剂。

除金龟子幼虫外，卫矛还可能会受到球蚧、卫矛矢尖盾蚧、卫矛尺蠖等虫害的影响。对于不同的虫害，需采取不同的防治方法，具体可咨询专业的植物保护人员或园艺师。