目前国内标准菌株种类很多，主要由国家和地方健康管理机构建立和运营。其中包括常见的病原菌，如金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌等，以及某些特殊用途的菌株，如草履腐霉等真菌。

这些标准菌株可用于质量控制、药物筛选、疫苗研制等方面的研究和应用。此外，为了确保标准菌株之间的可比性和稳定性，这些菌株数量和存储条件都需要严格管理和监控。