太湖珍珠鳖的天敌主要包括大型食肉鸟类、大型鱼类和其他捕食性爬行动物。然而，太湖中并没有天然存在的捕食者适应珍珠鳖的数量爆发，这使得其种群无法得到有效控制。

珍珠鳖还具有抗病性强、繁殖力强的特点，导致其进一步扩大了在太湖生态系统中的影响范围。