运动会上表演什么笛子曲最好，需要考虑到旋律和氛围。其中，《茉莉花》、《千本樱》、《梁祝》和《春江花月夜》等曲目都是极具代表性的笛子曲，其音乐旋律优美动听，具有浓郁的中国传统文化气息，能够吸引观众的注意力，同时还能为整个运动会增添一份儒雅文艺的氛围。

除此之外，根据不同的场景和主题，也可以选取其他符合题材的曲目，予以演出，以达到更好的效果。总之，选曲要因材施教，深入挖掘曲目内涵，才能让演出更具有吸引力和感染力。