1. 首先，需要联系当地的工商行政管理部门或相关机构，了解撤销的具体流程和所需材料。
2. 准备好相关材料，包括公司营业执照、法定代表人身份证明、申请书等。
3. 提交申请材料，并说明填错登记机关的情况，同时请求撤销原登记记录。
4. 等待审核，如果审核通过，工商行政管理部门会发布撤销公告，并将原登记记录从公共查询系统中删除。
5. 最后，重新提交正确的登记申请材料，并按照正常流程进行公司注册。
需要注意的是，不同地区的撤销流程和所需材料可能有所不同，建议在撤销前先咨询当地工商行政管理部门或相关机构，以确保按照正确的流程进行操作。